A GDPR egyik fontos újdonsága, hogy a területi hatálya - bizonyos feltételeke teljesülése esetén kiterjed - az Európai Unióban tevékenységi hellyel nem rendelkező adatkezelő vagy adatfeldolgozó által végzett adatkezelésre is (lásd 3. cikk (2) bekezdés). Az ún. extraterritoriális hatály hivatott biztosítani, hogy az adatok védelmére vonatkozó szabályok alkalmazása alól ne maradjanak ki azok az adatkezelők vagy adatfeldolgozók sem, amelyek az EU-ban ugyan nem telepednek le, de az uniós polgárokat érintően adatkezelési tevékenységet végeznek. Hasonló célt szolgálnak a GDPR nemzetközi adattovábbításra vonatkozó rendelkezései (GDPR V. fejezet), amely azon esetekre alkalmazandó, amikor az adatok harmadik országba vagy nemzetközi szervezet részére kerülnek továbbításra és erre tekintettel kell az adatok megfelelő szintű védelmét biztosítani.
A gyakorlatban azonban kérdéseket vet fel, hogy a GDPR területi hatályára vonatkozó szabályok (különösen az extraterritoriális hatály) és a nemzetközi adattovábbítás során alkalmazandó rendelkezések miként viszonyulnak egymáshoz. A gyakorlatban felmerülő jogértelmezési bizonytalanságok eloszlatásában segíthet az Európai Adatvédelmi Testület frissen - egyelőre véleményezhető tervezeti formában - közzétett iránymutatása, amely a GDPR 3. cikke (területi hatály) és V. fejezete (nemzetközi adattovábbítás) közötti kapcsolatot és kölcsönhatást elemzi.
Az iránymutatás leszögezi, hogy "a GDPR V. fejezetének rendelkezései arra szolgálnak, hogy kompenzálják azokat a kockázatokat és kiegészítsék a GDPR 3. cikkében meghatározott területi hatályra vonatkozó szabályait, amikor a személyes adatok az EU-n kívülre kerülnek továbbításra" (lásd iránymutatás 3. pont, 4. o.).